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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
16/12/2022 |
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Data da última atualização: |
24/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
ANJOS, L. M. dos. |
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Título: |
Diversidade genética de Plasmopara viticola e mapeamento de QTLs de resistência ao míldio em videira (Vitis spp.). |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
2013. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Fitopatologia) - Universidade de Brasília, DF. Orientador: Márcio Elias Ferreira, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Conteúdo: |
A videira (Vitis vinifera L.) destaca-se entre as mais importantes espécies frutíferas cultivadas mundialmente. O míldio, causado pelo oomyceto Plasmopara viticola (Berk & Curtis.) Berl. & de Toni é uma das principais doenças da videira no mundo, causando sérios prejuízos à vitivinicultura. Este trabalho envolveu um conjunto de experimentos visando gerar informações para estudos genéticos do gênero Plasmopara, infectando videiras no Brasil. O Capítulo 1 teve como objetivo estudar a diversidade genética e a estrutura populacional de isolados de Plasmopara viticola que infectam vinhedos em diferentes regiões brasileiras. Para isto, 34 novos marcadores microssatélites de P. viticola foram desenvolvidos através de sequenciamento NGS (Next Generation Sequencing) seguido de montagem parcial de novo do genoma do fungo. Testes dos novos marcadores juntamente com dez controles possibilitaram a seleção de uma bateria mista de 15 marcadores que foram usados para genotipar 92 isolados de P. viticola coletados em regiões produtoras de uva no Brasil. A amostra de 92 isolados apresentou estruturação, tendo sido dividida em três subpopulações, denominadas PvG1(Fst=0,56), PvG2 (Fst=0,25) e PvG3 (Fst=0,24). Foi observado um grande efeito no uso de pequenas baterias de marcadores moleculares na análise genética de populações do patógeno, afetando a interpretação dos resultados de substruturação populacional. A classificação geográfica dos isolados apresenta associação com a classificação subpopulacional do patógeno. Os isolados oriundos dos Estados de São Paulo e Minas Gerais apresentam maior diversidade de subpopulações do que isolados de outras regiões tradicionais xviii no cultivo de uva no Brasil, como o Rio Grande do Sul. O emprego de ferramentas moleculares como sequenciamento NGS e marcadores moleculares contribui para uma melhor compreensão das variáveis que afetam as populações de P. viticola. O Capítulo 2 teve por objetivo construir mapas genéticos para os genitores da progênie F1 do cruzamento CNPUV 733-34 x CNPUV 1103-88 e mapear regiões do genoma de videira que conferem resistência ao patógeno. O mapa do genitor feminino CNPUV 733-34 cobriu 1.104 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 6,69 cM. O mapa do genitor masculino CNPUV 1103-88 cobriu 958 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 7,48 cM. O fenótipo da interação patógeno-hospedeiro foi mensurado em bioensaios em ambiente controlado e infecção natural no campo. Três QTLs foram detectados por mapeamento de Intervalo Simples e Intervalo Composto no mapa genético do genitor feminino CNPUV 733-34. Um dos QTLs está localizado no GL 5, no intervalo entre os marcadores UDV041-UDV042 (LOD= 3,9) e explica 6% da variação fenotípica para resistência a P. viticola. Dois outros QTLs (C18-1 e C18-2), apresentam efeito moderado de resistência a P. viticola, foram detectados no GL 18, e explicam até 22,3% da variação fenotípica. O intervalo do QTL C18-1 (LOD= 7,6) é flanqueado pelos marcadores VMC7F2 e VVIN16, que estão separados por 5 cM. O intervalo do QTL C18-2 (LOD= 6,3) é flanqueado pelos marcadores VVIU04 e VVIN83, separados por 22 cM. O mapeamento genético de QTLs de resistência ao míldio utilizando diferentes fontes de resistência nos programas de melhoramento genético de videira é um passo importante para o aumento da eficiência de desenvolvimento de variedades resistentes ao patógeno. MenosA videira (Vitis vinifera L.) destaca-se entre as mais importantes espécies frutíferas cultivadas mundialmente. O míldio, causado pelo oomyceto Plasmopara viticola (Berk & Curtis.) Berl. & de Toni é uma das principais doenças da videira no mundo, causando sérios prejuízos à vitivinicultura. Este trabalho envolveu um conjunto de experimentos visando gerar informações para estudos genéticos do gênero Plasmopara, infectando videiras no Brasil. O Capítulo 1 teve como objetivo estudar a diversidade genética e a estrutura populacional de isolados de Plasmopara viticola que infectam vinhedos em diferentes regiões brasileiras. Para isto, 34 novos marcadores microssatélites de P. viticola foram desenvolvidos através de sequenciamento NGS (Next Generation Sequencing) seguido de montagem parcial de novo do genoma do fungo. Testes dos novos marcadores juntamente com dez controles possibilitaram a seleção de uma bateria mista de 15 marcadores que foram usados para genotipar 92 isolados de P. viticola coletados em regiões produtoras de uva no Brasil. A amostra de 92 isolados apresentou estruturação, tendo sido dividida em três subpopulações, denominadas PvG1(Fst=0,56), PvG2 (Fst=0,25) e PvG3 (Fst=0,24). Foi observado um grande efeito no uso de pequenas baterias de marcadores moleculares na análise genética de populações do patógeno, afetando a interpretação dos resultados de substruturação populacional. A classificação geográfica dos isolados apresenta associação com a classificação subpo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade; Diversity; Estrutura genética de populações; Genetic mapping; Grapevine; Mapeamento genético; Marcadores microssatélites; Microsatellite markers; Population genetic structure; Sequenciamento; Sequencing. |
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Thesagro: |
Míldio; Uva. |
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Thesaurus Nal: |
Downy mildew; Plasmopara viticola. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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520 $aA videira (Vitis vinifera L.) destaca-se entre as mais importantes espécies frutíferas cultivadas mundialmente. O míldio, causado pelo oomyceto Plasmopara viticola (Berk & Curtis.) Berl. & de Toni é uma das principais doenças da videira no mundo, causando sérios prejuízos à vitivinicultura. Este trabalho envolveu um conjunto de experimentos visando gerar informações para estudos genéticos do gênero Plasmopara, infectando videiras no Brasil. O Capítulo 1 teve como objetivo estudar a diversidade genética e a estrutura populacional de isolados de Plasmopara viticola que infectam vinhedos em diferentes regiões brasileiras. Para isto, 34 novos marcadores microssatélites de P. viticola foram desenvolvidos através de sequenciamento NGS (Next Generation Sequencing) seguido de montagem parcial de novo do genoma do fungo. Testes dos novos marcadores juntamente com dez controles possibilitaram a seleção de uma bateria mista de 15 marcadores que foram usados para genotipar 92 isolados de P. viticola coletados em regiões produtoras de uva no Brasil. A amostra de 92 isolados apresentou estruturação, tendo sido dividida em três subpopulações, denominadas PvG1(Fst=0,56), PvG2 (Fst=0,25) e PvG3 (Fst=0,24). Foi observado um grande efeito no uso de pequenas baterias de marcadores moleculares na análise genética de populações do patógeno, afetando a interpretação dos resultados de substruturação populacional. A classificação geográfica dos isolados apresenta associação com a classificação subpopulacional do patógeno. Os isolados oriundos dos Estados de São Paulo e Minas Gerais apresentam maior diversidade de subpopulações do que isolados de outras regiões tradicionais xviii no cultivo de uva no Brasil, como o Rio Grande do Sul. O emprego de ferramentas moleculares como sequenciamento NGS e marcadores moleculares contribui para uma melhor compreensão das variáveis que afetam as populações de P. viticola. O Capítulo 2 teve por objetivo construir mapas genéticos para os genitores da progênie F1 do cruzamento CNPUV 733-34 x CNPUV 1103-88 e mapear regiões do genoma de videira que conferem resistência ao patógeno. O mapa do genitor feminino CNPUV 733-34 cobriu 1.104 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 6,69 cM. O mapa do genitor masculino CNPUV 1103-88 cobriu 958 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 7,48 cM. O fenótipo da interação patógeno-hospedeiro foi mensurado em bioensaios em ambiente controlado e infecção natural no campo. Três QTLs foram detectados por mapeamento de Intervalo Simples e Intervalo Composto no mapa genético do genitor feminino CNPUV 733-34. Um dos QTLs está localizado no GL 5, no intervalo entre os marcadores UDV041-UDV042 (LOD= 3,9) e explica 6% da variação fenotípica para resistência a P. viticola. Dois outros QTLs (C18-1 e C18-2), apresentam efeito moderado de resistência a P. viticola, foram detectados no GL 18, e explicam até 22,3% da variação fenotípica. O intervalo do QTL C18-1 (LOD= 7,6) é flanqueado pelos marcadores VMC7F2 e VVIN16, que estão separados por 5 cM. O intervalo do QTL C18-2 (LOD= 6,3) é flanqueado pelos marcadores VVIU04 e VVIN83, separados por 22 cM. O mapeamento genético de QTLs de resistência ao míldio utilizando diferentes fontes de resistência nos programas de melhoramento genético de videira é um passo importante para o aumento da eficiência de desenvolvimento de variedades resistentes ao patógeno.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
08/01/2013 |
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Data da última atualização: |
23/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SILVA, M. R. da. |
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Afiliação: |
MANUELA RAMOS DA SILVA, UFRB. |
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Título: |
Caracterização física e anatômica de folhas de acessos de bananeira com diferentes ploidias. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2012. |
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Páginas: |
59f. |
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Descrição Física: |
il. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientador Sebastião de Oliveira e Silva; Co-orientadores Janay de Almeida Santos-Serejo; Edson Perito Amorim. |
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Conteúdo: |
A duplicação de cromossomos pode ser usada no melhoramento genético de cultivares de bananeiras para geração de triploides secundários. Em trabalhos dessa natureza necessitam-se de métodos para a estimativa da ploidia.Esse trabalho teve por objetivo avaliar o conteúdo de DNA, a espessura foliar, a caracterização anatômica e a turgescência foliar de genótipos de bananeira di, trie tetraploides, para posteriormente, relacionar tais caracteres com o número de cromossomos, e com uso dessa informação, estabelecer uma forma rápida de estimar ploidia. A avaliação do conteúdo de DNA foi realizada por citometria de fluxo nos diploides AA (Calcutta e NBA), triploides AAA (Grande Naine e Caipira) e tetraploides AAAA (Calypso e Bucanero). Para cada amostra foram realizadas quatro repetições e analisados cinco mil núcleos. A análise da massa especifica foi feita utilizando três discos retirados de cada uma das duas partes do limbo foliar, nas posições apical, mediana e basal da primeira, segunda e terceira folhas expandidas das mudas dos diploides AA (Calcutta e Lidi), triploides AAA (Grande Naine e Williams) e tetraploide AAAA (Bucanero e Calypso), utilizando-se quatro plantas para cada genótipo. Avaliou-se a massa fresca, seca (mg) e específica (mg cm-2) dos discos para os diferentes genótipos. A caracterização anatômica foi feita em amostras foliares seccionadas em cortes transversais e paradérmicos (face abaxial e adaxial) das mesmas plantas diploides, triploides e tetraploides usadas no experimento anterior, utilizando o microscópio Ken-a-vision. Já a avaliação da turgescência foliar foi feita usando o aparelho Wiltmeter®, por meio de análise direta das folhas e de discos foliares dos diferentes genótipos. Os resultados obtidos para o conteúdo de DNA mostraram que os genomas dos diploides possuem menor peso (0,96 pg), os triploides Grande Naine (1,48 pg) e Caipira (1,63 pg) apresentaram pesos intermediários, enquanto os tetraploides, Calypso (1,90 pg) e Bucanero (2,26 pg) foram os que apresentaram DNA mais pesados. A massa específica obtida da massa fresca dos discos foliares retirados da parte apical da folha apresentou uma boa relação com a ploidia. Assim os genótipos com maior ploidia foram os que apresentaram a mais alta massa fresca do disco foliar. No estudo anatômico observou-se que os genótipos tetraploides apresentaram estômatos maiores e em menor quantidade em comparação aos triploides e diploides. O potencial de turgescência está relacionado à ploidia, quando observado diretamente na planta pelo aparelho Wiltmeter® em leituras realizadas às 6:30 h da manhã. Plantas com maiores ploidias apresentam maior turgescência. MenosA duplicação de cromossomos pode ser usada no melhoramento genético de cultivares de bananeiras para geração de triploides secundários. Em trabalhos dessa natureza necessitam-se de métodos para a estimativa da ploidia.Esse trabalho teve por objetivo avaliar o conteúdo de DNA, a espessura foliar, a caracterização anatômica e a turgescência foliar de genótipos de bananeira di, trie tetraploides, para posteriormente, relacionar tais caracteres com o número de cromossomos, e com uso dessa informação, estabelecer uma forma rápida de estimar ploidia. A avaliação do conteúdo de DNA foi realizada por citometria de fluxo nos diploides AA (Calcutta e NBA), triploides AAA (Grande Naine e Caipira) e tetraploides AAAA (Calypso e Bucanero). Para cada amostra foram realizadas quatro repetições e analisados cinco mil núcleos. A análise da massa especifica foi feita utilizando três discos retirados de cada uma das duas partes do limbo foliar, nas posições apical, mediana e basal da primeira, segunda e terceira folhas expandidas das mudas dos diploides AA (Calcutta e Lidi), triploides AAA (Grande Naine e Williams) e tetraploide AAAA (Bucanero e Calypso), utilizando-se quatro plantas para cada genótipo. Avaliou-se a massa fresca, seca (mg) e específica (mg cm-2) dos discos para os diferentes genótipos. A caracterização anatômica foi feita em amostras foliares seccionadas em cortes transversais e paradérmicos (face abaxial e adaxial) das mesmas plantas diploides, triploides e tetraploides usada... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Banana. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aA duplicação de cromossomos pode ser usada no melhoramento genético de cultivares de bananeiras para geração de triploides secundários. Em trabalhos dessa natureza necessitam-se de métodos para a estimativa da ploidia.Esse trabalho teve por objetivo avaliar o conteúdo de DNA, a espessura foliar, a caracterização anatômica e a turgescência foliar de genótipos de bananeira di, trie tetraploides, para posteriormente, relacionar tais caracteres com o número de cromossomos, e com uso dessa informação, estabelecer uma forma rápida de estimar ploidia. A avaliação do conteúdo de DNA foi realizada por citometria de fluxo nos diploides AA (Calcutta e NBA), triploides AAA (Grande Naine e Caipira) e tetraploides AAAA (Calypso e Bucanero). Para cada amostra foram realizadas quatro repetições e analisados cinco mil núcleos. A análise da massa especifica foi feita utilizando três discos retirados de cada uma das duas partes do limbo foliar, nas posições apical, mediana e basal da primeira, segunda e terceira folhas expandidas das mudas dos diploides AA (Calcutta e Lidi), triploides AAA (Grande Naine e Williams) e tetraploide AAAA (Bucanero e Calypso), utilizando-se quatro plantas para cada genótipo. Avaliou-se a massa fresca, seca (mg) e específica (mg cm-2) dos discos para os diferentes genótipos. A caracterização anatômica foi feita em amostras foliares seccionadas em cortes transversais e paradérmicos (face abaxial e adaxial) das mesmas plantas diploides, triploides e tetraploides usadas no experimento anterior, utilizando o microscópio Ken-a-vision. Já a avaliação da turgescência foliar foi feita usando o aparelho Wiltmeter®, por meio de análise direta das folhas e de discos foliares dos diferentes genótipos. Os resultados obtidos para o conteúdo de DNA mostraram que os genomas dos diploides possuem menor peso (0,96 pg), os triploides Grande Naine (1,48 pg) e Caipira (1,63 pg) apresentaram pesos intermediários, enquanto os tetraploides, Calypso (1,90 pg) e Bucanero (2,26 pg) foram os que apresentaram DNA mais pesados. A massa específica obtida da massa fresca dos discos foliares retirados da parte apical da folha apresentou uma boa relação com a ploidia. Assim os genótipos com maior ploidia foram os que apresentaram a mais alta massa fresca do disco foliar. No estudo anatômico observou-se que os genótipos tetraploides apresentaram estômatos maiores e em menor quantidade em comparação aos triploides e diploides. O potencial de turgescência está relacionado à ploidia, quando observado diretamente na planta pelo aparelho Wiltmeter® em leituras realizadas às 6:30 h da manhã. Plantas com maiores ploidias apresentam maior turgescência.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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